168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0272 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0272  membrane protein  100 
 
 
297 aa  591  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  2.92393e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1092  hypothetical protein  49.81 
 
 
248 aa  254  9e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  39.15 
 
 
234 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  38.68 
 
 
234 aa  139  5e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  38.21 
 
 
234 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  36.79 
 
 
234 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  36.79 
 
 
234 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  36.79 
 
 
234 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  36.79 
 
 
234 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  35.92 
 
 
245 aa  131  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  38.89 
 
 
240 aa  130  2e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  34.91 
 
 
236 aa  129  8e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  36.07 
 
 
232 aa  129  8e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  35.38 
 
 
235 aa  129  8e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  34.13 
 
 
246 aa  128  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  36.32 
 
 
235 aa  128  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  36.48 
 
 
242 aa  128  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  35.38 
 
 
235 aa  127  2e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  36.73 
 
 
245 aa  127  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  36.02 
 
 
237 aa  127  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  33.96 
 
 
232 aa  126  4e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  36.28 
 
 
245 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  36.05 
 
 
242 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  125  8e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  125  8e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  35.38 
 
 
236 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  37.85 
 
 
234 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  1.07382e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  34.91 
 
 
236 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  35.38 
 
 
236 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  35.38 
 
 
236 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  34.55 
 
 
236 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  34.53 
 
 
240 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  34.05 
 
 
256 aa  120  2e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  31.28 
 
 
236 aa  121  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  32.5 
 
 
242 aa  120  4e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  31.56 
 
 
247 aa  120  4e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  39.2 
 
 
235 aa  120  4e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  34.03 
 
 
256 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  34.73 
 
 
256 aa  119  8e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  33.18 
 
 
236 aa  118  1e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  37.09 
 
 
233 aa  118  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  34.05 
 
 
248 aa  117  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  37.21 
 
 
256 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  38.69 
 
 
260 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  31.39 
 
 
236 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  33.71 
 
 
259 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  39.88 
 
 
261 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  33.8 
 
 
235 aa  115  7e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  38.69 
 
 
261 aa  115  7e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  31.54 
 
 
237 aa  115  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  31.54 
 
 
237 aa  115  1e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  34.31 
 
 
263 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  33.79 
 
 
219 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  30.04 
 
 
236 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  112  7e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  36.05 
 
 
255 aa  111  1e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  35 
 
 
257 aa  112  1e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  31.54 
 
 
236 aa  111  1e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  28.34 
 
 
238 aa  111  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  35.47 
 
 
255 aa  110  2e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  32.08 
 
 
242 aa  110  4e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  34.3 
 
 
263 aa  109  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  33.47 
 
 
263 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  34.73 
 
 
252 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  35.26 
 
 
274 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  34.76 
 
 
232 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.26118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  34.76 
 
 
252 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  32.03 
 
 
239 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  41.51 
 
 
271 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  32.55 
 
 
256 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  34.1 
 
 
274 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  31.54 
 
 
263 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  30.09 
 
 
224 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.26881e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 
236 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  28.38 
 
 
251 aa  102  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  32.74 
 
 
241 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.91773e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  32.89 
 
 
236 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  32.39 
 
 
224 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04302e-29 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  29.96 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.83428e-09  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  33.5 
 
 
234 aa  99.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.71893e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  39.64 
 
 
271 aa  99  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  36.78 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  29.2 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  26.29 
 
 
259 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  37.58 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  29.86 
 
 
240 aa  94.7  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  33.99 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  29.6 
 
 
241 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  27.93 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  4.19647e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1249  hypothetical protein  32.49 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.70984e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.09 
 
 
240 aa  89.7  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>