More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0251 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 		 355 aa  724    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.03 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  44.26 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  42.94 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.13 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  41.95 
 
 		 295 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  42.74 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.98 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.98 
 
 		 300 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.98 
 
 		 300 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  42.69 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.93 
 
 		 300 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  42.61 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  43.35 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  40.46 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  45.74 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  39.2 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  39.08 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  41.85 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  42.33 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.82 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  39.94 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  40.97 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  41.62 
 
 		 346 aa  222  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  42.94 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  41.43 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  41.86 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  39.49 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.71 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.57 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  35.9 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.6 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  37.64 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.77 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.77 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.21 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.36 
 
 		 299 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.79 
 
 		 303 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.77 
 
 		 318 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.62 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.78 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.9 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  32.66 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  33.24 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.2 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  36.31 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  40.87 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  32.66 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  33.43 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  53.8 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 		 322 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  35.88 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  36.52 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 302 aa  189  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.77 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  34.87 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  34.82 
 
 		 313 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  33.14 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  35.63 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.82 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  32.49 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.73 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  34.56 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  35.49 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.95 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  40.4 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  35.43 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  36.36 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  35 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  34.57 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  32.47 
 
 		 296 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  34.19 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  34.66 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  32.58 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  35.96 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  31.36 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  37.64 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  37.04 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  33.05 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.57 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  34.33 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  32.76 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  34.86 
 
 		 323 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  36.97 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>