28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0220 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  681    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  47.59 
 
 
753 aa  321  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.96 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  30.05 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  26.69 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.32 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  23.85 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  23.41 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  24.02 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  25 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  27.18 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.15 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  22.93 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.62 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.08 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.64 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  22.16 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.29 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  24.69 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  20.9 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.32 
 
 
366 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  23.4 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  19.42 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.5 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  27.01 
 
 
353 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.77 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  22.67 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.34 
 
 
366 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>