More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0205 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  72.45 
 
 
300 aa  449  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  43.57 
 
 
292 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 
296 aa  218  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  38.68 
 
 
301 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  36.05 
 
 
300 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  37.24 
 
 
303 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  34.65 
 
 
300 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  36.04 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  34.45 
 
 
297 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  33.45 
 
 
305 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  34.52 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  34.49 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
308 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  33.11 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.38 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  34.26 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  34.77 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  31.69 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  30.23 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  30.15 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  29.29 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  30.25 
 
 
294 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  30.31 
 
 
320 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  29.07 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  29.07 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  32.05 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.51 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  27.16 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.51 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  26.44 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  29.6 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  25.85 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  28.88 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.52 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.09 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.87 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  26.73 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  25.78 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  25.94 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.68 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.16 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  29.96 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.44 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.26 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.26 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  27.27 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  25.86 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.21 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.02 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.24 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.14 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  27.82 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  41.05 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  23.96 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  25.4 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  27.65 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.92 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  27.71 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.38 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  27.44 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  24.44 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  28.21 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.71 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  24.53 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  27.08 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.92 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.13 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.14 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  24.84 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  26.88 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  28.69 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  25.86 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  24.6 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  27.7 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  24.24 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  25.09 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  25.82 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.53 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  26.56 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  25.55 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  27.11 
 
 
353 aa  61.6  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  25.51 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  26.56 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>