43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0124 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  100 
 
 
445 aa  910  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.88669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  39.02 
 
 
415 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  40.9 
 
 
419 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  35.88 
 
 
427 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  31.55 
 
 
425 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  31.55 
 
 
430 aa  200  4e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.16 
 
 
410 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  33.05 
 
 
420 aa  196  5e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  32.96 
 
 
420 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  30.75 
 
 
426 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  30.67 
 
 
426 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  28.22 
 
 
422 aa  185  2e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  30.61 
 
 
421 aa  184  4e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  29.27 
 
 
448 aa  176  1e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  29.25 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  29.56 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  29.25 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  29.56 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.25 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  29.25 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  29.25 
 
 
417 aa  174  2e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  29.47 
 
 
435 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  29.47 
 
 
435 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  29.21 
 
 
435 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.89855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  27.18 
 
 
418 aa  162  8e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  27.36 
 
 
420 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  31.14 
 
 
418 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  27.04 
 
 
437 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  24.38 
 
 
391 aa  60.8  4e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  24.19 
 
 
397 aa  60.8  5e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
387 aa  56.6  8e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  5.2995e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  25 
 
 
387 aa  56.6  8e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
392 aa  55.5  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  23.6 
 
 
410 aa  50.4  6e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  25.5 
 
 
387 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.61 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  23.25 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  24.12 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  24.46 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  26.21 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.20862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  25.12 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>