178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0100 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0100  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  48.39 
 
 
418 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
397 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5071  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.33 
 
 
434 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1001  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.67 
 
 
434 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.14 
 
 
399 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20820  O-acetylhomoserine sulfhydrolase  41.67 
 
 
449 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3337  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.33 
 
 
432 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  33.87 
 
 
400 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1569  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  38.71 
 
 
438 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1104  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40 
 
 
434 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4319  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.33 
 
 
432 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.57 
 
 
396 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.1 
 
 
399 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2153  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.38 
 
 
422 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  43.33 
 
 
401 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  45.16 
 
 
387 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5616  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  43.33 
 
 
475 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.27 
 
 
394 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
394 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13373  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.44 
 
 
449 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.270333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0628  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.48 
 
 
447 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2667  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.57 
 
 
426 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  41.27 
 
 
390 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2703  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.57 
 
 
426 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.221221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4606  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  35.48 
 
 
431 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00390507  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2972  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.92 
 
 
429 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5065  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40 
 
 
430 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0796513  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4604  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40 
 
 
430 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.105232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1329  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35.8 
 
 
427 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440015  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1890  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1713  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3102  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33.33 
 
 
426 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2196  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
433 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2691  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.57 
 
 
427 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118315  normal  0.592625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1242  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  37.04 
 
 
427 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34221  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4276  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.38 
 
 
423 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  42.42 
 
 
379 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0901  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0911873  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1189  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0354  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase family protein  38.46 
 
 
682 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0263  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase family protein  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0489814  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2164  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.46 
 
 
431 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.717045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  34.85 
 
 
386 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  40.35 
 
 
383 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05980  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  35 
 
 
438 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  31.67 
 
 
391 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1708  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.57 
 
 
430 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.588932  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  40.28 
 
 
393 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  33.9 
 
 
399 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  40.35 
 
 
383 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  34.38 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  34.38 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  34.38 
 
 
386 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2546  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
423 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  49.12 
 
 
383 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1167  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33.33 
 
 
427 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1906  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  31.25 
 
 
423 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31162  predicted protein  34.85 
 
 
440 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2012  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.38 
 
 
425 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1988  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.57 
 
 
434 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00818201  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  38.33 
 
 
391 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5033  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.75936 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4675  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3688  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 
393 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3584  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  30.16 
 
 
397 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  40.32 
 
 
383 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0793  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35 
 
 
427 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2422  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1327  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  32.81 
 
 
425 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2101  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  32.79 
 
 
425 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881759  normal  0.1274 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5428  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3834  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.436075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  41.94 
 
 
383 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2528  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  32.81 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.300174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1095  O-acetylhomoserine (thiol)-lyase, putative  29.69 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  42.42 
 
 
379 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2264  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.76 
 
 
428 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1331  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  32.93 
 
 
431 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  43.86 
 
 
406 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3571  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0928  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0966  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3160  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.23 
 
 
435 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4016  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.1 
 
 
450 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 
392 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3374  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.33 
 
 
390 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0932  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0790  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  35 
 
 
427 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3191  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  32.81 
 
 
425 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134888  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0867  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.52 
 
 
426 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  0.769255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40 
 
 
397 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3447  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  29.69 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2492  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33.75 
 
 
428 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>