More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0093 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  61.75 
 
 
251 aa  305  7e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  59.06 
 
 
251 aa  298  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  54.4 
 
 
259 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.97 
 
 
252 aa  263  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
255 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  54.04 
 
 
245 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  54.39 
 
 
253 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  51.59 
 
 
245 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.25 
 
 
246 aa  248  9e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
245 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  51.25 
 
 
265 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  49.21 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  54.11 
 
 
242 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  51.49 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  51.49 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  51.49 
 
 
242 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  48.44 
 
 
256 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
249 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  51.22 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  51.08 
 
 
262 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  47.97 
 
 
247 aa  228  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  49.78 
 
 
249 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  49.59 
 
 
246 aa  227  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  48.05 
 
 
241 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0663  ABC transporter related  51.42 
 
 
258 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0260553  hitchhiker  0.00587802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  51.08 
 
 
244 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  50.22 
 
 
259 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.01 
 
 
250 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.01 
 
 
250 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.01 
 
 
250 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  49.2 
 
 
247 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 
240 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.9 
 
 
268 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.62 
 
 
250 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 
243 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  50.43 
 
 
244 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  46.34 
 
 
242 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.21 
 
 
250 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  49.78 
 
 
249 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.01 
 
 
250 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
245 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  47.97 
 
 
242 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  49.35 
 
 
249 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.6 
 
 
300 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  48.25 
 
 
252 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.21 
 
 
250 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.21 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.21 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  51.69 
 
 
257 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
247 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
240 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  51.95 
 
 
252 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.97 
 
 
255 aa  225  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
240 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
240 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 
244 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.13 
 
 
246 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
240 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  47.35 
 
 
242 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  48.31 
 
 
274 aa  224  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
240 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  49.15 
 
 
242 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  46 
 
 
245 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  49.79 
 
 
249 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 
244 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  50.65 
 
 
251 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  46.9 
 
 
266 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  49.36 
 
 
263 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  46.86 
 
 
241 aa  223  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  48.99 
 
 
241 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.12 
 
 
246 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.22 
 
 
250 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  49.35 
 
 
248 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  49.58 
 
 
242 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  47.97 
 
 
241 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  48.57 
 
 
254 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
240 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  49 
 
 
248 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
242 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  47.18 
 
 
242 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  47.31 
 
 
258 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  47.18 
 
 
242 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  48.16 
 
 
251 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.86 
 
 
264 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  49.19 
 
 
247 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.19 
 
 
250 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  52.38 
 
 
264 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
260 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  47.31 
 
 
258 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>