More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0082 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  87.7 
 
 
187 aa  354  3.9999999999999996e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  64.32 
 
 
199 aa  261  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  63.78 
 
 
187 aa  260  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  66.49 
 
 
187 aa  259  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  65.41 
 
 
211 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  65.38 
 
 
185 aa  257  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  63.78 
 
 
187 aa  255  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  64.67 
 
 
186 aa  254  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  63.59 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  64.13 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  65.38 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  64.84 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  64.67 
 
 
186 aa  252  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  63.93 
 
 
186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  62.16 
 
 
187 aa  250  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  64.29 
 
 
204 aa  249  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  63.19 
 
 
185 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  63.24 
 
 
187 aa  248  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  61.96 
 
 
187 aa  248  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  61.96 
 
 
187 aa  247  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  61.96 
 
 
187 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  61.96 
 
 
187 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  61.96 
 
 
187 aa  247  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  64.32 
 
 
187 aa  247  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  63.19 
 
 
187 aa  246  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  63.74 
 
 
187 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  63.24 
 
 
187 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  61.62 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  61.54 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  62.64 
 
 
185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  63.24 
 
 
216 aa  242  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  61.08 
 
 
187 aa  241  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  60.99 
 
 
187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  60.99 
 
 
185 aa  237  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  61.75 
 
 
186 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  60.44 
 
 
187 aa  235  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  61.54 
 
 
187 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  51.63 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  48.09 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  48.63 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  48.09 
 
 
185 aa  191  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  46.99 
 
 
185 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  46.74 
 
 
186 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  46.99 
 
 
185 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  45.65 
 
 
186 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  46.49 
 
 
186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  49.2 
 
 
189 aa  188  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  46.15 
 
 
185 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  48.63 
 
 
185 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  45.11 
 
 
186 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  46.7 
 
 
185 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  46.2 
 
 
186 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  46.49 
 
 
187 aa  187  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  45.11 
 
 
186 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  48.91 
 
 
188 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  46.15 
 
 
185 aa  185  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  47.54 
 
 
185 aa  185  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  47.8 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  46.7 
 
 
185 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  46.99 
 
 
185 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  46.7 
 
 
185 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  46.15 
 
 
186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  43.48 
 
 
186 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  44.51 
 
 
185 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.96 
 
 
188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  47.28 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  44.51 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  47.28 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  47.28 
 
 
188 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  44.26 
 
 
185 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  45.6 
 
 
185 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  43.41 
 
 
185 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  48.09 
 
 
192 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  44.57 
 
 
189 aa  176  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  46.37 
 
 
185 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  42.31 
 
 
185 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  44.26 
 
 
185 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  44.51 
 
 
186 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.05 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  42.62 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  42.62 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  43.41 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  45.6 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  44.32 
 
 
186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  44.51 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  42.7 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  45.41 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>