More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0061 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  100 
 
 		 421 aa  846    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  58.37 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  40.26 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 		 392 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  33.78 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 381 aa  143  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  30.09 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  25.97 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.41 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  26.46 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  22.85 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.65 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.5 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  27.62 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  29.47 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  27.01 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  26.48 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  27.33 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  26.02 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  26.27 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.78 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  27.71 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.19 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.19 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.73 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.69 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  25.54 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  26.52 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  26.52 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  26.28 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  25.61 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  26.95 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  26.84 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  27.16 
 
 		 413 aa  93.6  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  31.58 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  25.89 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  31.18 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  35.47 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  24.7 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  27.32 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51609  predicted protein  25.69 
 
 		 529 aa  92.8  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  24.25 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  23.77 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  32.11 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  26.63 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  22.36 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  23.92 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  29.7 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  29.7 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  29.7 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  25.64 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  24.02 
 
 		 508 aa  89.7  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  25.23 
 
 		 426 aa  89.7  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  27.67 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  23.59 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  23.68 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  23.68 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  25.24 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  23.68 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  30.53 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  23.68 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  23.59 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  32.76 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  23.36 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  23.59 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  23.59 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  23.59 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  29.1 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  24.54 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  23.48 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  23.26 
 
 		 405 aa  86.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  25 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3983  aminotransferase AlaT  29.47 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  30.37 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  30 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.51 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  23.17 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  23.99 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.34 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  23.2 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>