More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0046 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  62.12 
 
 		 522 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  100 
 
 		 513 aa  1039    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  65.41 
 
 		 526 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  57.54 
 
 		 507 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  58.45 
 
 		 529 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  55.16 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  53.97 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  54.76 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  50.2 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 526 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  48.1 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  48.1 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  48.1 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  47.9 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  49.1 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  47.49 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  47.12 
 
 		 511 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  47.21 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  48.39 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  48.99 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  49.19 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  49.19 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  47.59 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  47.49 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  47.18 
 
 		 506 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  47.23 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  47.81 
 
 		 507 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  47.28 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  47.28 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  49.5 
 
 		 506 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.34 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  46.46 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  48.34 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  47.81 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  48.34 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  47.24 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  47.5 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  46.46 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  48.8 
 
 		 502 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  46.51 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  46.64 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  46.44 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  46.52 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  46.92 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.51 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.12 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  42.32 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  44.05 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.12 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.57 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.27 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  42.71 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.02 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.68 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.1 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.49 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.92 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  42.24 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.96 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.77 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.01 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.33 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.43 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.29 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.08 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.01 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.48 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  40.27 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.13 
 
 		 514 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.13 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  39.37 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.13 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.12 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.03 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.08 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  39.2 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.44 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  39.31 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>