283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0031 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1805  Integrase  100 
 
 
321 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  100 
 
 
321 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  100 
 
 
321 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  99.69 
 
 
321 aa  652    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  30 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  29.97 
 
 
310 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  30.34 
 
 
311 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  30.43 
 
 
316 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  26.96 
 
 
621 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  29.04 
 
 
330 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  29.04 
 
 
330 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  29.04 
 
 
330 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  29.04 
 
 
330 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  31.2 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  34 
 
 
449 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  26.42 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  26.42 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  26.42 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  26.42 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  25.42 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  26.28 
 
 
323 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  27.51 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  29.28 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  27.54 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  23.53 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  30.2 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  26.06 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.14 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  34.12 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  25 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  32.65 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  28.43 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  28.91 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  26.64 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  31.14 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  24.76 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  26.84 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  32 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  27.51 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  24.83 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  24.83 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  28.74 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  27.85 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.43 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.64 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  24.68 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  31.87 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.83 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  31.43 
 
 
360 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  30.05 
 
 
324 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  30.92 
 
 
364 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  24.68 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.75 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  27.63 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.45 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.65 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.45 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.62 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  25.77 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  23.4 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  20.93 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  21.11 
 
 
307 aa  56.2  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.58 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.05 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.68 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  23.08 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.28 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.08 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.38 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.95 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  25.48 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.99 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  23.68 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.97 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.51 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.42 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.05 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.05 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  22.64 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>