63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0012 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  100 
 
 		 500 aa  1023    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  36.7 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  33.94 
 
 		 547 aa  90.5  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 549 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  35.78 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.7 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.52 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  33.18 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 586 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  32.83 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  32.55 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 534 aa  67  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.5 
 
 		 596 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.85 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  33.58 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  29.28 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 598 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  27.68 
 
 		 542 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.63 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  33.58 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.13 
 
 		 520 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.14 
 
 		 486 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.8 
 
 		 535 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  35.33 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.19 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.19 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  26.71 
 
 		 555 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.28 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.79 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.21 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 524 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 531 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  30.19 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.88 
 
 		 542 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.78 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.13 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  26.06 
 
 		 504 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  25 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  25.57 
 
 		 609 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  25.89 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  31.53 
 
 		 555 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  27.88 
 
 		 543 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  24.19 
 
 		 410 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  24.19 
 
 		 410 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  24.19 
 
 		 410 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>