More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK4427 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  98.49 
 
 
332 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  94.88 
 
 
332 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  99.1 
 
 
332 aa  678    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  99.1 
 
 
332 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  100 
 
 
332 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  98.8 
 
 
332 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  99.1 
 
 
332 aa  678    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  96.39 
 
 
332 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  98.49 
 
 
332 aa  674    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  98.49 
 
 
332 aa  675    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  99.1 
 
 
332 aa  678    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  75.3 
 
 
331 aa  527  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  72.89 
 
 
330 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  56.02 
 
 
329 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  55.42 
 
 
329 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  55.42 
 
 
329 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  51.21 
 
 
333 aa  344  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0707  RegM family transcriptional regulator  51.06 
 
 
334 aa  342  5e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000462743  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  51.36 
 
 
331 aa  329  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  51.06 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1713  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 
326 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  46.71 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  45.73 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.62 
 
 
337 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  46.83 
 
 
346 aa  292  7e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  43.07 
 
 
332 aa  279  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.51 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 
336 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  42.22 
 
 
332 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  41.92 
 
 
332 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0684  LacI family transcription regulator  41.99 
 
 
328 aa  262  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0236047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.27 
 
 
339 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  40.85 
 
 
337 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.52 
 
 
330 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 
335 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 
386 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  39.4 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 
342 aa  242  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.29 
 
 
348 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.69 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.11 
 
 
335 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 
343 aa  235  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.3 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.3 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  37.99 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.97 
 
 
343 aa  231  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.97 
 
 
343 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.97 
 
 
341 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.88 
 
 
341 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37 
 
 
330 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 
368 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 
353 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  36.78 
 
 
341 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 
359 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.61 
 
 
347 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
346 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.39 
 
 
342 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 
323 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.2 
 
 
347 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 
340 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.89 
 
 
347 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
332 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  36.67 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  39.16 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.74 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
339 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
351 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  36.94 
 
 
346 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.67 
 
 
334 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  36.31 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.98 
 
 
348 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  35.65 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.45 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  35.95 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  36.64 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.24 
 
 
334 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.31 
 
 
342 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  36.51 
 
 
361 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  37.76 
 
 
337 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 
337 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 
358 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.56 
 
 
328 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  36.67 
 
 
337 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 
338 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.87 
 
 
356 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>