More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK3897 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  94.42 
 
 
412 aa  811  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  98.54 
 
 
412 aa  844  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  99.51 
 
 
412 aa  852  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  99.51 
 
 
412 aa  852  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  99.51 
 
 
412 aa  852  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  88.35 
 
 
412 aa  777  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  99.51 
 
 
412 aa  852  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  96.84 
 
 
412 aa  830  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  100 
 
 
412 aa  855  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  98.79 
 
 
412 aa  845  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  52.81 
 
 
414 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  50.38 
 
 
414 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  39.25 
 
 
399 aa  274  2e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 
409 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  34.54 
 
 
395 aa  245  1e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 
408 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 
393 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 
409 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.09 
 
 
371 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 
423 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
410 aa  239  6e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.33 
 
 
372 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.87 
 
 
413 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 
385 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.34 
 
 
409 aa  236  5e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
409 aa  234  2e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  36.96 
 
 
407 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 
385 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  34.99 
 
 
425 aa  232  8e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  35.92 
 
 
400 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 
400 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 
411 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 
410 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  33.93 
 
 
395 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.08 
 
 
409 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  33.84 
 
 
411 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  32.43 
 
 
426 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 
397 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 
419 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 
419 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  35.85 
 
 
367 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 
358 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.36 
 
 
389 aa  223  5e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.19 
 
 
378 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 
378 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  3.1101e-06 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 
360 aa  222  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 
381 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 
374 aa  222  1e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 
413 aa  222  1e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  34.45 
 
 
356 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  34.45 
 
 
356 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  35.61 
 
 
399 aa  221  2e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  35.9 
 
 
351 aa  220  4e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 
363 aa  220  4e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 
384 aa  220  4e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.08 
 
 
408 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  35.9 
 
 
351 aa  219  8e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  37.4 
 
 
352 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  35.61 
 
 
351 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 
481 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 
351 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.98 
 
 
359 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
399 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  35.01 
 
 
356 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  34.82 
 
 
420 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  35.53 
 
 
354 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 
408 aa  217  3e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
425 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.04 
 
 
407 aa  216  6e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.82 
 
 
414 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.59 
 
 
413 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  35.13 
 
 
351 aa  215  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.60383e-06 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  35.28 
 
 
380 aa  215  1e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 
359 aa  215  1e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 
354 aa  215  1e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  36.73 
 
 
364 aa  214  2e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  214  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  214  3e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.62 
 
 
364 aa  213  4e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  36.57 
 
 
359 aa  212  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  212  8e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  34.49 
 
 
359 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 
399 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 
385 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  36.49 
 
 
353 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.17 
 
 
410 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  36.34 
 
 
359 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  34.97 
 
 
378 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 
390 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  36.18 
 
 
391 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  36.07 
 
 
359 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  37.61 
 
 
357 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 
368 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 
418 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>