More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK1039 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  43.99 
 
 
1244 aa  1013  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  37.02 
 
 
1282 aa  791  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.79 
 
 
1241 aa  2524  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  98.95 
 
 
1241 aa  2527  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.07 
 
 
1241 aa  2511  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  97.74 
 
 
1241 aa  2503  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.79 
 
 
1240 aa  2516  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  38.24 
 
 
1392 aa  821  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  40.16 
 
 
1248 aa  895  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  100 
 
 
1241 aa  2549  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.53 
 
 
1230 aa  893  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  43.66 
 
 
1233 aa  937  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  42.81 
 
 
1251 aa  978  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  36.86 
 
 
1217 aa  743  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  36.86 
 
 
1217 aa  743  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  90.17 
 
 
1242 aa  2325  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  38.29 
 
 
1236 aa  838  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  39.68 
 
 
1377 aa  666  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  40.33 
 
 
1270 aa  902  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.61 
 
 
1271 aa  905  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  96.62 
 
 
1241 aa  2467  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.95 
 
 
1241 aa  2527  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  54.28 
 
 
1242 aa  1274  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  98.71 
 
 
1241 aa  2522  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  56.96 
 
 
1244 aa  1370  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  98.95 
 
 
1241 aa  2527  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  35.75 
 
 
1218 aa  716  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.01 
 
 
1230 aa  632  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  32.61 
 
 
1204 aa  604  1e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.84 
 
 
1186 aa  592  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  32.67 
 
 
1392 aa  508  1e-142  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  31.08 
 
 
1217 aa  476  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.02 
 
 
1203 aa  462  1e-128  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  30.3 
 
 
1207 aa  452  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 
1121 aa  446  1e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  30.34 
 
 
1240 aa  443  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  39.92 
 
 
1405 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 
1184 aa  204  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.42 
 
 
1057 aa  201  1e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 
1080 aa  183  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.76 
 
 
1139 aa  181  6e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 
1074 aa  180  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  26.03 
 
 
1061 aa  174  7e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 
1117 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 
1165 aa  166  2e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  25.22 
 
 
1124 aa  159  5e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  29.54 
 
 
1196 aa  158  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 
1120 aa  157  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 
1115 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 
1123 aa  157  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.72 
 
 
1089 aa  155  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.26 
 
 
1155 aa  154  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 
1202 aa  151  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.25 
 
 
1161 aa  151  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 
1162 aa  149  4e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  24.97 
 
 
1124 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 
1149 aa  145  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.19 
 
 
1119 aa  144  1e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.53 
 
 
1156 aa  143  2e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.87 
 
 
1226 aa  143  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 
1061 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 
1121 aa  140  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 
1147 aa  139  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  26.24 
 
 
1147 aa  135  7e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 
1019 aa  134  8e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 
1065 aa  133  2e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  24.38 
 
 
1156 aa  134  2e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 
1110 aa  133  2e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  24.26 
 
 
1164 aa  132  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 
1161 aa  132  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.5 
 
 
678 aa  131  7e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 
1168 aa  131  9e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.87 
 
 
1110 aa  130  1e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  23.68 
 
 
1110 aa  129  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.9 
 
 
1198 aa  129  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.9 
 
 
1198 aa  129  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.65 
 
 
1125 aa  129  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 
1130 aa  128  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.61 
 
 
1262 aa  128  8e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  23.09 
 
 
1185 aa  128  8e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  25.45 
 
 
1177 aa  127  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  23.12 
 
 
1076 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23 
 
 
1161 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.79 
 
 
755 aa  127  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.58 
 
 
1089 aa  127  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  23.46 
 
 
1101 aa  124  1e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.55 
 
 
1155 aa  124  1e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  22.95 
 
 
1140 aa  123  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 
1173 aa  123  2e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.76 
 
 
1203 aa  123  2e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  23.7 
 
 
1083 aa  122  5e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.47 
 
 
1086 aa  121  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.33 
 
 
1168 aa  120  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  25.56 
 
 
1187 aa  120  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  24.76 
 
 
1125 aa  119  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.24 
 
 
741 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 
1101 aa  119  4e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 
802 aa  119  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  23.62 
 
 
1151 aa  118  7e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 
1095 aa  117  1e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>