274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0630 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0630  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  48.8 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  45.8 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  45.8 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  52 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  45.8 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  48.8 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  48 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  44.8 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  50.79 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  50.79 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  49.21 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  49.21 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  48.41 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  45.6 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  41.98 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  45.04 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  36.09 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  37.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  37.1 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  38.21 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  35.07 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  35.07 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  39.2 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  35.2 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3560  ribosome-binding factor A  41.13 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  35.88 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  36.64 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  38.4 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3388  ribosome-binding factor A  35.88 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.990819  hitchhiker  0.00369045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3059  ribosome-binding factor A  35.61 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.491319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  35.88 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1696  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  32.82 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  32.5 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  37.93 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2833  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3416  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.523215  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1129  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0360009  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3238  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3279  ribosome-binding factor A  36.59 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  38.66 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  35.65 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  31.2 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  33.86 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  35.34 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  36.21 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  31.71 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  33.87 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  32.77 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0818  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  33.06 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  28.8 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>