More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0612 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  100 
 
 
198 aa  396  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  59.39 
 
 
195 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  62.12 
 
 
192 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  62.12 
 
 
192 aa  248  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  62.12 
 
 
192 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  57.87 
 
 
195 aa  241  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  55.56 
 
 
190 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  55.78 
 
 
195 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  54.77 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  55.93 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  56.82 
 
 
196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  55.93 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  55.93 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  55.93 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  55.93 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  55.93 
 
 
197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.37 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  52.28 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  52.28 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  52.28 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  57.8 
 
 
241 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  57.8 
 
 
250 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  55.75 
 
 
197 aa  204  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  47.45 
 
 
211 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  48.44 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  51.85 
 
 
198 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  48.47 
 
 
212 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  49.4 
 
 
209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  50.33 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  46.43 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  47.78 
 
 
194 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  40.1 
 
 
200 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  51.45 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  47.47 
 
 
209 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  42.36 
 
 
205 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  46.29 
 
 
187 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  44.86 
 
 
203 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
203 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
206 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  45.81 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  44.86 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  49.03 
 
 
189 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  49.04 
 
 
185 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  49.04 
 
 
185 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  44.32 
 
 
206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 
194 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  46.84 
 
 
209 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 
187 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  44.44 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  43.62 
 
 
193 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
206 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  49.03 
 
 
184 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  44.71 
 
 
206 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  40.51 
 
 
201 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  47.44 
 
 
189 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  40.12 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  46.62 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  49.62 
 
 
210 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  44.06 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  48.32 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  45.22 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  40.3 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  47.79 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  47.41 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  40.38 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  48.55 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
199 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  46.1 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  42.24 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  45.19 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  34.69 
 
 
218 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  42.67 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  40.65 
 
 
240 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  37.35 
 
 
208 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  38.06 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
202 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
181 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 
179 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
181 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
181 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  42.22 
 
 
181 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>