267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0561 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  100 
 
 
165 aa  340  5e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  54.66 
 
 
165 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  54.37 
 
 
160 aa  184  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  55.9 
 
 
160 aa  181  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  55.28 
 
 
160 aa  181  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  56.52 
 
 
160 aa  181  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
159 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  50.62 
 
 
159 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
159 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
159 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
159 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
196 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
196 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
196 aa  174  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  50 
 
 
159 aa  174  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  47.83 
 
 
159 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
159 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
161 aa  142  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
163 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  41.76 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  42.24 
 
 
195 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 
169 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.48 
 
 
160 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 
170 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  45.78 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
171 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.48 
 
 
160 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  47.48 
 
 
160 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
171 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.53 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.29 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.28 
 
 
170 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  47.79 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
177 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  37.43 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  46.76 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.96 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  46.76 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  38.36 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  40.85 
 
 
163 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 
160 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
165 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  39.51 
 
 
166 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
171 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
161 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  41.25 
 
 
161 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  43.05 
 
 
160 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.17 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  39.51 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
172 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 
169 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  38.18 
 
 
166 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 
162 aa  117  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  40.37 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  39.38 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
166 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  36.09 
 
 
171 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0353  dihydrofolate reductase FolA  39.02 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 
162 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  36.42 
 
 
162 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0378  dihydrofolate reductase FolA  40.24 
 
 
163 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  38.1 
 
 
168 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  35.8 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  36.25 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>