299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0355 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0355  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.337369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t008  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0016  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000937466  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0014  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0130  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000480729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0124  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0015  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294168  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  98.36 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t004  tRNA-Thr  98.33 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811739  normal  0.123776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00077  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000431752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4286  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.21666e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0014  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000357359  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0088  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4355  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000300865  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4474  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000220241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4551  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000130381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5103  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000647348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0008  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000889632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4427  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000793255  hitchhiker  0.0000458064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4477  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000501815  hitchhiker  0.00000000000000791993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4696  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.54682e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4387  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4720  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.2702999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5444  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000119489  hitchhiker  0.00131782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0008  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000537274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0081  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000871845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0106  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000701517  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2802  tRNA-Thr  93.59 
 
 
78 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000503689  normal  0.100014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0008  tRNA-Thr  93.59 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000148165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4781  tRNA-Thr  96.72 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0075  tRNA-Thr  96.72 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000445566  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0091  tRNA-Thr  93.33 
 
 
76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.13219e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  92.31 
 
 
79 bp  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0018  tRNA-Thr  93.44 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  91.53 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  95.65 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  95.65 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  95.65 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  95.65 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  95.65 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  95.56 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0012  tRNA-Ile  90.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  95.45 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  95.35 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  95.35 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t09  tRNA-Ile  93.48 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  93.48 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t70  tRNA-Ile  93.48 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619158  hitchhiker  0.00932375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0098  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000369381  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0092  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368423  hitchhiker  0.00436649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0059  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000552358  normal  0.693628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0014  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192391  hitchhiker  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0079  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000309524  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0007  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00099613  hitchhiker  0.000158126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0055  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.290237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0009  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0460221  hitchhiker  0.00205125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0010  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000315774  hitchhiker  0.000925503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0073  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000465984  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0032  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000276963  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0063  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000331537  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0026  tRNA-Thr  95.24 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000120513  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  95.24 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0081  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  normal  0.185006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0022  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000998833  hitchhiker  0.000594977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0005  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000179229  normal  0.648072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0035  tRNA-Ile  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000956793  normal  0.185983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00059  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0008  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0006  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000680631  normal  0.388884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0094  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.115915  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0024  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0720012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3695  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0596681  normal  0.112328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3589  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.236614  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0074  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3758  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0631  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000484892  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0010  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.3598  normal  0.190518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0075  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4594  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.559283  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3660  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0084  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.193841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3588  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.25198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4207  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0107638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5073  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3568  tRNA-Thr  88.52 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.607966  normal  0.920561 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0010  tRNA-Thr  88.52 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>