More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0189 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  100 
 
 
108 aa  218  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  69.44 
 
 
108 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  68.52 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  65.74 
 
 
109 aa  160  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  68.52 
 
 
108 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  64.81 
 
 
109 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  66.67 
 
 
108 aa  158  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  66.67 
 
 
108 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  65.74 
 
 
108 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  65.74 
 
 
108 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  65.74 
 
 
108 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  144  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  62.04 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  62.04 
 
 
108 aa  141  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  61.11 
 
 
108 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  56.6 
 
 
109 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  58.33 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  56.48 
 
 
108 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  59.26 
 
 
108 aa  136  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  136  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  136  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  59.26 
 
 
108 aa  136  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  58.33 
 
 
108 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  54.55 
 
 
110 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  58.49 
 
 
109 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  56.48 
 
 
108 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  53.7 
 
 
108 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  133  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  53.7 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  57.55 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  52.83 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  54.72 
 
 
109 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  54.72 
 
 
109 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54.63 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54.63 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  53.33 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  53.7 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  53.77 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  52.78 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  127  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  49.07 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  51.85 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  54.08 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  50.93 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  50.93 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  50 
 
 
146 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  50 
 
 
108 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  50.96 
 
 
110 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>