43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0101 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.354435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.92 
 
 		 263 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.92 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.54 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  33.48 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.74 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  31.22 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.94 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  31.22 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.94 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  34.25 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  30.49 
 
 		 262 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.14 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.14 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.14 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  29.88 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  27.41 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  27.92 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  31.21 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  24.44 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  26.77 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  25.17 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  23.78 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  30.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  28.26 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  25.79 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.01 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  32.93 
 
 		 487 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 243 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>