More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0094 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
556 aa  706    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
556 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
556 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
556 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
556 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
556 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
555 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  67.7 
 
 
554 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  66.37 
 
 
552 aa  791    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 
556 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 
555 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
556 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 
559 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
555 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
553 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  67.99 
 
 
552 aa  805    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  66.79 
 
 
555 aa  793    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  63.77 
 
 
556 aa  770    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
555 aa  797    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  800    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
555 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
552 aa  781    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 
556 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
556 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 
554 aa  792    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 
552 aa  796    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 
552 aa  768    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
556 aa  1160    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
571 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 
555 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
555 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 
555 aa  723    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
558 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
556 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
555 aa  797    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 
548 aa  745    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 
554 aa  799    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
556 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
556 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
556 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 
556 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
555 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 
556 aa  766    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 
556 aa  715    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
565 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
565 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
555 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
568 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
554 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
568 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
558 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
561 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
555 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
567 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
569 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
590 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 
565 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
566 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
564 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
609 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
572 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
559 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
561 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
582 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
580 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
569 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
556 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
567 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
551 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
576 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
556 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  51 
 
 
553 aa  594  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
587 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
558 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
551 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
596 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
569 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
562 aa  588  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
570 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
565 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
576 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
570 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
564 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>