121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0093 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0093  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.22077e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.52915e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.31572e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.62709e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  5.8826e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.91902e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.25e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.16589e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.89236e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.58312e-09  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.85411e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  92.94 
 
 
85 bp  113  7e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.38486e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  92.94 
 
 
87 bp  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  6.06436e-06  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  90.59 
 
 
87 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.81775e-06  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  90.59 
 
 
87 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.46268e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.61598e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  90.12 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.41901e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  92.54 
 
 
82 bp  85.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  7.67874e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  92.54 
 
 
82 bp  85.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  92.54 
 
 
82 bp  85.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  92.54 
 
 
82 bp  85.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  92.54 
 
 
82 bp  85.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  9.97462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.94739e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.33162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.90562e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.90983e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.36232e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.24514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.67918e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  81.8  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.09594e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  79.8  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  79.8  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  79.8  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  79.8  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  94 
 
 
85 bp  75.8  1e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.0879e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  94 
 
 
85 bp  75.8  1e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  90.91 
 
 
82 bp  75.8  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.08106e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.86761e-09  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.02689e-07  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.84266e-07  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  93.88 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  93.88 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.02771e-09  hitchhiker  8.27914e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.86418e-05  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  92.45 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.37125e-05  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  93.88 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.88757e-08  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  73.8  6e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  6.51737e-09  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  95.45 
 
 
85 bp  71.9  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.35684e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  95.45 
 
 
85 bp  71.9  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.00033e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  95.45 
 
 
85 bp  71.9  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.14198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  93.75 
 
 
88 bp  71.9  2e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  95.35 
 
 
85 bp  69.9  9e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  95.35 
 
 
85 bp  69.9  9e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.18199e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  90.57 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  91.84 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.53856e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.33579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.39603e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  8.11763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  95 
 
 
83 bp  63.9  6e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  95 
 
 
80 bp  63.9  6e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  63.9  6e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 
83 bp  63.9  6e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  91.49 
 
 
84 bp  61.9  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  9e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t015  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t010  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  8.27659e-10  hitchhiker  5.2642e-10 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.05134e-08  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.79854e-07  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0057  tRNA-Leu  91.11 
 
 
80 bp  58  3e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0744744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0111  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.89505e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.19757e-05  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.90142e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  86.96 
 
 
85 bp  58  3e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.10809e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  86.3 
 
 
85 bp  58  3e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.03773e-09  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  91.11 
 
 
83 bp  58  3e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  89.13 
 
 
82 bp  52  2e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  89.13 
 
 
82 bp  52  2e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.13 
 
 
82 bp  52  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.13 
 
 
82 bp  52  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  89.13 
 
 
81 bp  52  2e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  89.13 
 
 
82 bp  52  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>