172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0092 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0092  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.603959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0129  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000954421  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0127  tRNA-Gln  91.89 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0027737  normal  0.534366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  90.54 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  91.8 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0052  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0099  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0040  tRNA-Gln  95.65 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  92.45 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3143t  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000544986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3152t  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000938948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3147t  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000099101  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3145t  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1773  tRNA-Gln  90.91 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0033  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0065  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000612595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0067  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0071  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0072  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0102  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0103  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0012  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12185  normal  0.483393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0028  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0026  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.151797  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0002  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  87.69 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0008  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.865665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlnVIMSS1309278  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  87.69 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0041  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0029  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0079  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0053  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0046  tRNA-Gln  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0016  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0036  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0037  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000166881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0040  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0097  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000737452  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0098  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000673061  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA16  tRNA-Gln  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>