More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0083 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  100 
 
 
144 aa  290  5e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  78.87 
 
 
146 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  78.87 
 
 
146 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  78.87 
 
 
146 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  78.17 
 
 
146 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  77.78 
 
 
144 aa  227  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  78.17 
 
 
146 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  77.78 
 
 
144 aa  227  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  77.08 
 
 
146 aa  225  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  77.62 
 
 
144 aa  225  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  76.92 
 
 
143 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  77.08 
 
 
144 aa  223  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  76.92 
 
 
143 aa  223  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  76.92 
 
 
143 aa  223  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  75.52 
 
 
146 aa  219  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  75.18 
 
 
145 aa  215  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  75.18 
 
 
145 aa  215  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  75.89 
 
 
145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  75.18 
 
 
145 aa  213  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  45.83 
 
 
149 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
144 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  36.76 
 
 
144 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
141 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
158 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  39.2 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
157 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  37.76 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  36.43 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  39.17 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.65 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
169 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>