262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0080 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0080  ferredoxin II, 4Fe-4S type  100 
 
 
62 aa  124  5e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  64.29 
 
 
196 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  64.29 
 
 
192 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  61.4 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  60.34 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.41 
 
 
404 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  59.65 
 
 
196 aa  77  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  55.93 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.32 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  58.93 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  55.93 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.32 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  59.26 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  59.68 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.14 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
204 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
204 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
204 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
199 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  59.32 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  57.63 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  54.1 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  55.93 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  54.24 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  61.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.56 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  55.56 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  54.24 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  54.84 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  55.56 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.63 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  59.26 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  54.1 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.26 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  54.24 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  53.45 
 
 
189 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  50.85 
 
 
290 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  50.85 
 
 
290 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  50.85 
 
 
290 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  50.85 
 
 
290 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  50.85 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0830  putative electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214006  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  50.85 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0852  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  50.85 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  49.21 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.61 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  55.36 
 
 
681 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0881  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  53.57 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161363  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  50.85 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  54.39 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  50.85 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  54.1 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  49.21 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  53.97 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  55.36 
 
 
139 aa  66.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  55.36 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  47.46 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  50.85 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  50.85 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  47.46 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  50 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.82 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.54 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  47.46 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  52.46 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  50 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  54.24 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  51.79 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  50.88 
 
 
306 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  50.88 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  50.88 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.88 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  47.46 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>