More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0036 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
424 aa  875    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.51 
 
 
428 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.65 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.65 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.32 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.8 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.41 
 
 
428 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.32 
 
 
428 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.85 
 
 
429 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  60.28 
 
 
429 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  60.28 
 
 
429 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  541  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.27 
 
 
432 aa  542  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.81 
 
 
429 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.37 
 
 
429 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
429 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.61 
 
 
429 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
430 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
429 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
429 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.52 
 
 
427 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.24 
 
 
429 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  59 
 
 
429 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.19 
 
 
429 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  59 
 
 
431 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  59 
 
 
431 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  59 
 
 
430 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.45 
 
 
431 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.77 
 
 
431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.29 
 
 
428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.06 
 
 
428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.45 
 
 
432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.64 
 
 
426 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
430 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.06 
 
 
431 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.35 
 
 
430 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.35 
 
 
429 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.11 
 
 
429 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  55.92 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.39 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  57.11 
 
 
430 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.58 
 
 
431 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.82 
 
 
430 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.4 
 
 
427 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 
431 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.45 
 
 
432 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.51 
 
 
433 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.92 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.28 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.45 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 
432 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.22 
 
 
432 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.81 
 
 
433 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 
432 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 
432 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.11 
 
 
422 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.87 
 
 
432 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 
430 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.75 
 
 
432 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 
432 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.81 
 
 
433 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.4 
 
 
428 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.66 
 
 
430 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.03 
 
 
428 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.19 
 
 
429 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.43 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
437 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.5 
 
 
437 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.5 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.16 
 
 
426 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.72 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.01 
 
 
430 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  52 
 
 
428 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.55 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  52 
 
 
428 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.11 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 
425 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
430 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.85 
 
 
433 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
425 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.76 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.92 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
426 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.02 
 
 
422 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 
422 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.49 
 
 
425 aa  438  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 
422 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 
422 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.64 
 
 
427 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 
432 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>