More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5316 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  98.93 
 
 
375 aa  762  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  98.67 
 
 
375 aa  760  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  98.93 
 
 
375 aa  759  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  98.93 
 
 
375 aa  762  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  99.2 
 
 
375 aa  761  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  96.26 
 
 
375 aa  744  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  98.67 
 
 
375 aa  760  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  98.93 
 
 
375 aa  762  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  95.19 
 
 
373 aa  728  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  100 
 
 
375 aa  767  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  98.67 
 
 
375 aa  760  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  66.67 
 
 
374 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  65.76 
 
 
372 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  55.11 
 
 
370 aa  416  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  55.11 
 
 
370 aa  416  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  55.56 
 
 
371 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  50.94 
 
 
374 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  49.6 
 
 
374 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.4 
 
 
374 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.52 
 
 
373 aa  358  7e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  48.14 
 
 
369 aa  341  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  48.52 
 
 
359 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  46.47 
 
 
366 aa  329  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  44.17 
 
 
375 aa  308  1e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.36 
 
 
386 aa  305  1e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  42.05 
 
 
361 aa  303  2e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  42.05 
 
 
361 aa  303  2e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.82 
 
 
371 aa  303  5e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.16 
 
 
360 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  42.51 
 
 
369 aa  282  8e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  40.98 
 
 
371 aa  275  1e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.69 
 
 
372 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.63 
 
 
376 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.76 
 
 
371 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  38.07 
 
 
364 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.8 
 
 
365 aa  255  1e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.18 
 
 
392 aa  244  1e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  38.74 
 
 
384 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.17 
 
 
376 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  33.88 
 
 
365 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  33.06 
 
 
365 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.81 
 
 
370 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  37.03 
 
 
362 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  35.77 
 
 
364 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.36 
 
 
360 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.23 
 
 
364 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  36.99 
 
 
386 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  35.04 
 
 
398 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  36.06 
 
 
369 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.22 
 
 
390 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  37.83 
 
 
380 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  37.83 
 
 
380 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  34.14 
 
 
370 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  35.26 
 
 
377 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.25 
 
 
362 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.99 
 
 
382 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  31 
 
 
402 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.88 
 
 
397 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.55 
 
 
377 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  30.65 
 
 
401 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  32.88 
 
 
371 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.16 
 
 
401 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.94 
 
 
377 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.84 
 
 
397 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  35.15 
 
 
363 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  32.58 
 
 
371 aa  201  1e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  34.1 
 
 
394 aa  201  1e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  35.55 
 
 
385 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 
370 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.77 
 
 
363 aa  198  1e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.7 
 
 
374 aa  197  2e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.27 
 
 
386 aa  196  4e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  35.83 
 
 
387 aa  196  4e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.24 
 
 
390 aa  196  4e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  31.89 
 
 
390 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 
387 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.97 
 
 
369 aa  196  8e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.17 
 
 
398 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.51 
 
 
414 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.74 
 
 
415 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.51254e-07  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  34.77 
 
 
365 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 
359 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  36.15 
 
 
352 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  30.4 
 
 
399 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  32.01 
 
 
377 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.79 
 
 
399 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.92 
 
 
378 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  30.71 
 
 
380 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  30.87 
 
 
380 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  30.71 
 
 
380 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.97 
 
 
380 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  29.05 
 
 
390 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  35.09 
 
 
348 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.38 
 
 
365 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  32.01 
 
 
376 aa  189  6e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  34.91 
 
 
348 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  28.77 
 
 
404 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.61 
 
 
381 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  30.65 
 
 
368 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.81 
 
 
420 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>