More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4000 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 		 307 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0122358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  98.37 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1446  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  92.51 
 
 		 307 aa  593  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1405  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  92.51 
 
 		 307 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1206  RNA pseudouridylate synthase  91.86 
 
 		 307 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.575901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  91.86 
 
 		 307 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1382  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  91.86 
 
 		 307 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.53631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1304  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  91.86 
 
 		 307 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1184  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase D  91.21 
 
 		 307 aa  580  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1208  RluA family pseudouridine synthase  90.52 
 
 		 307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1014  RluA family pseudouridine synthase  77.12 
 
 		 307 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  55.74 
 
 		 304 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1383  pseudouridine synthase, RluA family  52.88 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3230  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0916  RluA family pseudouridine synthase  37.72 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1348  RluA family pseudouridine synthase  35.74 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.628416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1288  RluA family pseudouridine synthase  37.81 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.543506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0777  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1110  RluA family pseudouridine synthase  36.75 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1255  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.39 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1322  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.62 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0584  RluA family pseudouridine synthase  34.98 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.460121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1284  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  35.15 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4086  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.13 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1103  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase D  34.81 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1097  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  35.96 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1904  pseudouridine synthase  36.59 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.014884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1938  pseudouridine synthase  36.59 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.153319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1360  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  34.93 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1121  pseudouridine synthetase  34.47 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1214  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  34.47 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0593  pseudouridine synthase, RluA family  31.93 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000735687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1649  RluA family pseudouridine synthase  35.64 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0803  RluA family pseudouridine synthase  32.06 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0330464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2377  RluA family pseudouridine synthase  32.31 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2089  pseudouridylate synthase family protein, yabo  32.54 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  34.01 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2390  pseudouridine synthase, RluA family  34.84 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.837448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  36.9 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  37.87 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  39.31 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1632  pseudouridine synthase, RluA family  34.95 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  38.93 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0252  RluA family pseudouridine synthase  34.31 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.995369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.93 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  38.93 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  38.93 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  37.93 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  38.93 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2067  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.68 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0259  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  36 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  40.82 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.42 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  36.79 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.55 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  38.95 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  38.17 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  32.31 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  33.88 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.11 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  34.92 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.99 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  36.14 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  38.04 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1386  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.38 
 
 		 274 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.019865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  35.23 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1825  pseudouridine synthase  32.64 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  32.12 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  37.19 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.11 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.36 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  36.9 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  35.63 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  35.42 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1158  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  36.5 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.55 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  35.51 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3699  pseudouridine synthase, RluA family  31.41 
 
 		 345 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  35.51 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  37.74 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  37.74 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  36.88 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  34.48 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2034  pseudouridine synthase, RluA family  31.68 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0680786  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  36.72 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.22 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.67 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  36.72 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  33.11 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  37.45 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.56 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.41 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0195  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  36.72 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0799995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  34.85 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  37.66 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.39 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.57 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  33.93 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.71 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>