More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2836 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  55.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  55.98 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  55.43 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  55.43 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  55.43 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  55.43 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  55.43 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  55.43 
 
 
181 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  54.89 
 
 
181 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  53.8 
 
 
181 aa  203  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  36.52 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  35.96 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  35.96 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  35.96 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  35.39 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  41.21 
 
 
213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.11 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  30.94 
 
 
152 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 
189 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 
190 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.87 
 
 
236 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
223 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.04 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 
191 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.87 
 
 
236 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 
193 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  29.51 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
227 aa  88.2  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
199 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.73 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  31.14 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  24.59 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  29.34 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
211 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  27.81 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  28.11 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  25.84 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>