More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1408 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.28023e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.66649e-08  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.56327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.63382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.22021e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.5219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
241 aa  493  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.15432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  93.78 
 
 
241 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.01833e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  99.56 
 
 
228 aa  468  1e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.26178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  97.93 
 
 
246 aa  453  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.10605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  69.29 
 
 
243 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  69.71 
 
 
243 aa  357  8e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 
244 aa  191  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.39729e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 
246 aa  175  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.4 
 
 
237 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
237 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
246 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  35.09 
 
 
237 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
239 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
249 aa  114  1e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  32.17 
 
 
239 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
232 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 
285 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  28 
 
 
277 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
232 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 
248 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
247 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  27.71 
 
 
234 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  28.09 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  27.75 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.57 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  27.76 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.84 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
267 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
235 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.88 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.47 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.34 
 
 
239 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  27.31 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  29.36 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.34 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  29.91 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  29.91 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  26.92 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.91 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
248 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
248 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>