More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0807 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  99.33 
 
 
450 aa  922  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  99.33 
 
 
450 aa  922  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  98.89 
 
 
450 aa  920  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  99.33 
 
 
450 aa  924  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 
450 aa  929  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  99.56 
 
 
450 aa  926  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  99.33 
 
 
450 aa  923  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  99.56 
 
 
450 aa  926  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  99.33 
 
 
450 aa  924  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  76.59 
 
 
448 aa  719  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  929  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  76.59 
 
 
448 aa  719  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  94.44 
 
 
450 aa  889  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  74.09 
 
 
448 aa  692  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  79.78 
 
 
449 aa  760  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  80.22 
 
 
451 aa  768  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.47616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.53 
 
 
471 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  51.98 
 
 
435 aa  445  1e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.21997e-06  hitchhiker  7.85503e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  50 
 
 
436 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.93 
 
 
449 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.66 
 
 
438 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  46.98 
 
 
434 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  44.58 
 
 
454 aa  408  1e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  50.47 
 
 
439 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.94 
 
 
450 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.81 
 
 
450 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.84 
 
 
434 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.84 
 
 
434 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  41.84 
 
 
434 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  42.55 
 
 
431 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  44.58 
 
 
437 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.09 
 
 
456 aa  343  3e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  4.54579e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.71 
 
 
429 aa  342  6e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.71 
 
 
429 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  41.45 
 
 
441 aa  340  2e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.23 
 
 
435 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  2.07484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.55 
 
 
466 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  41.61 
 
 
446 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.39 
 
 
444 aa  328  1e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.26 
 
 
441 aa  327  4e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.79 
 
 
439 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  40.38 
 
 
438 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.37 
 
 
431 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.77 
 
 
444 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.44 
 
 
425 aa  314  2e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.69 
 
 
432 aa  314  2e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.27 
 
 
434 aa  313  4e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  39.13 
 
 
458 aa  312  8e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.16 
 
 
430 aa  312  9e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.67 
 
 
449 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.63 
 
 
442 aa  309  6e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.7 
 
 
438 aa  306  5e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.2 
 
 
417 aa  303  6e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  5.62047e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.37 
 
 
442 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  38.27 
 
 
446 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.83 
 
 
427 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.85 
 
 
438 aa  286  6e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.08 
 
 
495 aa  285  1e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  40.27 
 
 
458 aa  284  2e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.2 
 
 
447 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.59 
 
 
421 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.2 
 
 
447 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  37.59 
 
 
440 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  35.37 
 
 
480 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.15 
 
 
429 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  35.93 
 
 
443 aa  274  2e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  35.36 
 
 
440 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.43 
 
 
456 aa  273  5e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.13731e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  34.59 
 
 
497 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.36 
 
 
471 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  35.28 
 
 
450 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  34.35 
 
 
413 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.32 
 
 
420 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.79 
 
 
434 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.6 
 
 
444 aa  267  3e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 
451 aa  267  3e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.10311e-07  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  37.05 
 
 
470 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.51 
 
 
416 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  36.99 
 
 
497 aa  265  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  34.82 
 
 
478 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.19842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.09 
 
 
509 aa  262  9e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.67 
 
 
451 aa  262  9e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  34.47 
 
 
451 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.17118e-07  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  36.41 
 
 
452 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.74 
 
 
434 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  39.04 
 
 
462 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1428  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.86 
 
 
509 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0860  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.57 
 
 
514 aa  259  5e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.71 
 
 
523 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.61282e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  35.94 
 
 
444 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.42644e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.27 
 
 
447 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.61297e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.4 
 
 
509 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  35 
 
 
487 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.74817e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.25 
 
 
531 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.4 
 
 
509 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  36.72 
 
 
496 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.4 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.4 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.4 
 
 
509 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  32.94 
 
 
416 aa  256  7e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>