More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0057 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  100 
 
 
381 aa  784    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5606  integrase family protein  50.13 
 
 
390 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0056  integrase-recombinase  52.79 
 
 
390 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0611528  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  31.33 
 
 
317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  30.72 
 
 
347 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  30.72 
 
 
347 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  30.12 
 
 
347 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  28.21 
 
 
386 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  26.42 
 
 
332 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  25.84 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  34.67 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  26.64 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  30.99 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  27.5 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.44 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.9 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.72 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.19 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  29.67 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.25 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  26.54 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  32.47 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  30.36 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  30.36 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  30.36 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  30.36 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.33 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.15 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.57 
 
 
295 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  22.52 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 
297 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  23.33 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.75 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.25 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  28 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.27 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  26.45 
 
 
291 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.37 
 
 
302 aa  67  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  23.89 
 
 
608 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  24.63 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  26.86 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  21.99 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  30.38 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  23.89 
 
 
608 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  24.69 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  30.38 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.76 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  23.89 
 
 
608 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.8 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  31.79 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.15 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28.88 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  27.31 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.39 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  25.5 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  26.03 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  29.61 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  20.86 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.68 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.18 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  26.01 
 
 
298 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  30.06 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  22.36 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  24.15 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 
321 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.26 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  30.2 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  28.91 
 
 
311 aa  64.3  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  25.86 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  23.22 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  21.81 
 
 
335 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.83 
 
 
295 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>