More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0242 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  100 
 
 		 519 aa  1059    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  100 
 
 		 372 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  53.95 
 
 		 384 aa  326  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  62.05 
 
 		 370 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  40 
 
 		 361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  41.3 
 
 		 373 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  34.9 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.01 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  33.82 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 364 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 364 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  40.79 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  32.85 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 388 aa  97.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 388 aa  97.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  29.64 
 
 		 388 aa  97.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  34.68 
 
 		 399 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  34.68 
 
 		 399 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  27.38 
 
 		 385 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  34.68 
 
 		 399 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 401 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 295 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  33.14 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  28.92 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 310 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.36 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  33.64 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.49 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.64 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  27.35 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  32.8 
 
 		 141 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.21 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.23 
 
 		 285 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.49 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  23.62 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  23.62 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  23.62 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.92 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  24.9 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  29.07 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  29.07 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  26.92 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  30 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  25.39 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  25.84 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  31 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25.49 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.7 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.6 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.8 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.97 
 
 		 322 aa  67  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 440 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  29 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  27.82 
 
 		 334 aa  67  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  27.82 
 
 		 334 aa  67  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>