219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0234 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  100 
 
 
108 aa  223  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  99.07 
 
 
108 aa  221  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.29 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  34.29 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 
459 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.91 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  29.91 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 
374 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.29 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.29 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  30 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 
380 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.29 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  28.57 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.29 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
224 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.36 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.25 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.25 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
205 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
321 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  33.33 
 
 
227 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 
229 aa  50.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
210 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 
364 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 
258 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  38.33 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.55 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  30 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.55 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1148  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  27.59 
 
 
436 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 
301 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 
247 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  28.85 
 
 
380 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
242 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
322 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 
334 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  36.67 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  36.67 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  36.21 
 
 
358 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
134 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  28.57 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  29.85 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.66 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
432 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
231 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 
131 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
200 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  27.62 
 
 
374 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  37.29 
 
 
244 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  32.26 
 
 
293 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  28.33 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  27.88 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>