More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0001 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  56.66 
 
 
675 aa  804    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  50.52 
 
 
708 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  99.85 
 
 
701 aa  1425    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  100 
 
 
684 aa  1425    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  26.5 
 
 
630 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  27.16 
 
 
637 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  27.92 
 
 
498 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  25.75 
 
 
637 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  23.54 
 
 
737 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  23.54 
 
 
721 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  23.54 
 
 
721 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  22.47 
 
 
491 aa  97.8  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  23.19 
 
 
426 aa  96.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  24.43 
 
 
637 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  23.35 
 
 
638 aa  92  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  28.94 
 
 
663 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  23.36 
 
 
647 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  23.36 
 
 
647 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  23.36 
 
 
647 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  25 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  25 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  24.74 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  23.99 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  22.22 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  22.22 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  22.22 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  27.78 
 
 
724 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.73 
 
 
300 aa  65.1  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  27.78 
 
 
724 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  27.78 
 
 
724 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  27.78 
 
 
724 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.4 
 
 
381 aa  63.9  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 
301 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  40.86 
 
 
316 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.36 
 
 
322 aa  61.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  51.92 
 
 
313 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  26.83 
 
 
308 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  27.88 
 
 
328 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 
386 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  24.31 
 
 
409 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.07 
 
 
404 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 
299 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  23.04 
 
 
310 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27 
 
 
296 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.53 
 
 
367 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.95 
 
 
429 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 
300 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 
299 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  24.08 
 
 
310 aa  57.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  24.68 
 
 
744 aa  57.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  23.19 
 
 
617 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  23.08 
 
 
343 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  22.74 
 
 
343 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  23.19 
 
 
617 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.59 
 
 
322 aa  57.4  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28 
 
 
421 aa  57.4  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.33 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  21.67 
 
 
299 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.83 
 
 
291 aa  57  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.44 
 
 
275 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.06 
 
 
401 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  21.41 
 
 
307 aa  56.6  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 
305 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  33.98 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.66 
 
 
326 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  24.77 
 
 
329 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 
290 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.4 
 
 
300 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  25.08 
 
 
310 aa  55.5  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  44.44 
 
 
320 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  22.88 
 
 
341 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.93 
 
 
313 aa  55.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  26.67 
 
 
719 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
354 aa  55.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 
295 aa  55.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  30.63 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  32.1 
 
 
739 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.31 
 
 
299 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  30.63 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  30.63 
 
 
741 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>