More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5039 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  98.25 
 
 
114 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  98.25 
 
 
114 aa  229  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  98.25 
 
 
114 aa  229  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  98.25 
 
 
114 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  98.25 
 
 
114 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  97.37 
 
 
114 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  97.37 
 
 
114 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  95.61 
 
 
114 aa  224  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  85.96 
 
 
133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  53.64 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  54.63 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  45.19 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  41.74 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  42.15 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1710  RNA-binding protein  39.17 
 
 
127 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.034913  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  45.19 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.74 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.74 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  55.26 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  37.5 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  55.26 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  45.19 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  44.34 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.44 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  42.98 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.17 
 
 
164 aa  77  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  42.59 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  42.45 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  42.59 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1228  RNA-binding protein  49.32 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0834946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  43.24 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  55.56 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  39.29 
 
 
736 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  44.32 
 
 
557 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  50 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  47.56 
 
 
686 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  41.12 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 
568 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  41.23 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  40 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  45.26 
 
 
557 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 
568 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 
568 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  39.36 
 
 
756 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  44.05 
 
 
405 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
577 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
571 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.75 
 
 
723 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
589 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  42.67 
 
 
718 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
576 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  46.05 
 
 
579 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
576 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
576 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  42.67 
 
 
718 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  31.93 
 
 
562 aa  72  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
576 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  43.75 
 
 
570 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.33 
 
 
514 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  44 
 
 
722 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.33 
 
 
503 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  37.23 
 
 
754 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  42.86 
 
 
407 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 
378 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  41.77 
 
 
705 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  49.3 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 
378 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  42.67 
 
 
817 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.45 
 
 
543 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  43.48 
 
 
399 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  47.62 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  47.56 
 
 
561 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  44.57 
 
 
720 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  47.62 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 
578 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  40.18 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  41.94 
 
 
560 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  47.56 
 
 
561 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.5 
 
 
543 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>