More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4536 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  200  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  200  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  200  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  98.04 
 
 
102 aa  195  2e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  84.31 
 
 
102 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  82.35 
 
 
102 aa  172  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  67.33 
 
 
104 aa  148  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  143  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.76664e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  143  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.5429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  68.32 
 
 
104 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 
102 aa  138  2e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  8.16286e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
104 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  60.78 
 
 
102 aa  133  7e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 
103 aa  129  1e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  63.37 
 
 
103 aa  127  7e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  124  4e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  60.4 
 
 
102 aa  122  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
156 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  62.75 
 
 
104 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  62.5 
 
 
104 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  62.38 
 
 
104 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  58.82 
 
 
103 aa  119  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 
102 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  53.92 
 
 
149 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  57.58 
 
 
99 aa  114  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  59.41 
 
 
105 aa  114  4e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  51.46 
 
 
103 aa  113  8e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  59.22 
 
 
132 aa  113  1e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  112  1e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  112  1e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
103 aa  112  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  59.22 
 
 
103 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
100 aa  112  2e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  53.54 
 
 
100 aa  111  4e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.39901e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
102 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 
103 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  110  7e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.65275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  110  7e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 
104 aa  110  7e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  55.34 
 
 
114 aa  110  7e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
104 aa  108  2e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  108  2e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
101 aa  109  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 
99 aa  107  4e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.04369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
102 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  107  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  107  8e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  106  9e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.30006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
101 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  4.86349e-08  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
100 aa  105  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 
103 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 
103 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  53.68 
 
 
101 aa  105  3e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
130 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.45664e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.50093e-10  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  6.37379e-11  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
224 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
102 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.70537e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.20592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.90707e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>