More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4421 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  99.58 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  98.31 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  79.74 
 
 		 236 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  78.11 
 
 		 245 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  97.9 
 
 		 149 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  64.59 
 
 		 226 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  60.96 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  60 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  58.56 
 
 		 239 aa  269  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.94 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  55.7 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  54.67 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  56.19 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  55.71 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  55.25 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.12 
 
 		 207 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  51.9 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  48.1 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  52.45 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  47.52 
 
 		 239 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  50.48 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  100 
 
 		 100 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  45.33 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  45.33 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  47.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  43.28 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  44.07 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  46.73 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  48.02 
 
 		 239 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  47.95 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  47.03 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  42.42 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  48.34 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  47.39 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  44.12 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  45.63 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  40.38 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  66.07 
 
 		 114 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  66.67 
 
 		 118 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  60 
 
 		 126 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  61.06 
 
 		 118 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  54.63 
 
 		 113 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  30.11 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  36.51 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.19 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  31.56 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  30.8 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  29.89 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  31.51 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.15 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  31.15 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.77 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  31.38 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.3 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  34.31 
 
 		 232 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  31.73 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  29.76 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  28.73 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  31.73 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  29.83 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.77 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.15 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.89 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.33 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4595  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.57 
 
 		 640 aa  92  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>