163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4378 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  97.18 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  95.97 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  95.56 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 		 248 aa  487  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  90.73 
 
 		 248 aa  470  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  56.68 
 
 		 263 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  54.25 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  32.79 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  30.4 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  28.51 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  26.03 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.91 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  29.57 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  26.17 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  29.57 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.41 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  28.24 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  29.65 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  25.61 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.55 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.76 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  25.21 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.32 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.75 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25.26 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  24.66 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  24.66 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.32 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.74 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  25.82 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  28.98 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  21.9 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  25.76 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  25.3 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  30.68 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  25.2 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  26.1 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  23.41 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  28.07 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  25.31 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  26.67 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  30.27 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  24.71 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  29.31 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  27.91 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  26.21 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  27.37 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  25.44 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  27.37 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  24.71 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  26.29 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  25.89 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  25.77 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  27.17 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  24.28 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>