More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4065 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  90.1 
 
 
586 aa  1124    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  100 
 
 
586 aa  1222    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  60.21 
 
 
588 aa  783    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  96.42 
 
 
586 aa  1187    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  96.25 
 
 
586 aa  1186    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  96.25 
 
 
586 aa  1186    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  92.83 
 
 
586 aa  1157    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  96.42 
 
 
586 aa  1187    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  77.65 
 
 
586 aa  988    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  92.83 
 
 
586 aa  1158    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  97.95 
 
 
586 aa  1203    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  96.25 
 
 
586 aa  1186    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  64.1 
 
 
589 aa  835    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  46.09 
 
 
610 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  46.58 
 
 
610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  45.26 
 
 
587 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  46.08 
 
 
574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  48.94 
 
 
584 aa  514  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  45.92 
 
 
589 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 
582 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  42.47 
 
 
574 aa  442  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  42.21 
 
 
583 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  36.78 
 
 
575 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  45.03 
 
 
477 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  40.56 
 
 
578 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  41.91 
 
 
481 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  36.59 
 
 
586 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  41.99 
 
 
496 aa  362  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 
481 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  41.09 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  38.67 
 
 
481 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  33.22 
 
 
576 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  38.51 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  36.23 
 
 
486 aa  337  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 
481 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  39.84 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  40.99 
 
 
481 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  38.91 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 
483 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  40.5 
 
 
487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  36.18 
 
 
476 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  34.9 
 
 
663 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  38.7 
 
 
459 aa  294  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 
486 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 
486 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  32.33 
 
 
617 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  39.36 
 
 
480 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 
614 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  29.23 
 
 
608 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  30.04 
 
 
644 aa  256  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.81 
 
 
1847 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  33.82 
 
 
475 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.87 
 
 
715 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1414  alpha amylase catalytic region  29.89 
 
 
703 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0623392  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  33.47 
 
 
474 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  30.69 
 
 
659 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  28.18 
 
 
1643 aa  237  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 
1307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  32.94 
 
 
609 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  32.13 
 
 
473 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  32.13 
 
 
473 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  33.33 
 
 
609 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.85 
 
 
1401 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  29.75 
 
 
607 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  30.2 
 
 
1193 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  30.24 
 
 
606 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  31.33 
 
 
605 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.31 
 
 
1401 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.1 
 
 
1175 aa  219  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0286  alpha amylase catalytic region  28.67 
 
 
611 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.109454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  29.87 
 
 
651 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 
605 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  31.48 
 
 
605 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  29.34 
 
 
1299 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  31.48 
 
 
605 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  27.79 
 
 
914 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  31.31 
 
 
605 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  31.7 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
1753 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  31.7 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  31.7 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  31.7 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  30.97 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  31.15 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 
576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.92 
 
 
608 aa  214  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  31.7 
 
 
605 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  29.16 
 
 
580 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  31.51 
 
 
604 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  30.97 
 
 
622 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  29.28 
 
 
479 aa  206  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 
635 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  32.47 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.15 
 
 
1145 aa  201  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  28.76 
 
 
727 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  31.18 
 
 
562 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  27.13 
 
 
596 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 
510 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  28.11 
 
 
634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.73 
 
 
511 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>