More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3781 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3630  sensory box/GGDEF family protein  62.67 
 
 
828 aa  1061    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.931883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2548  sensory box/GGDEF family protein  62.94 
 
 
828 aa  1056    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19879e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  62.07 
 
 
911 aa  1131    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  91.93 
 
 
906 aa  1699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.80269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3781  sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
910 aa  1858    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.424975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5426  sensory box/GGDEF family protein  44.32 
 
 
909 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.54 
 
 
909 aa  773    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2357  sensory box/GGDEF family protein  61.63 
 
 
912 aa  1130    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3594  sensory box/GGDEF family protein  96.76 
 
 
911 aa  1751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5151  sensory box/GGDEF family protein  43.49 
 
 
909 aa  766    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.954767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2314  sensory box/GGDEF family protein  61.39 
 
 
912 aa  1122    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.6229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3494  sensory box/GGDEF family protein  96.65 
 
 
911 aa  1749    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0435317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4983  sensory box/GGDEF family protein  43.27 
 
 
909 aa  764    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2272  sensory box/GGDEF family protein  61.41 
 
 
912 aa  1124    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3506  sensory box/GGDEF family protein  96.65 
 
 
911 aa  1750    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.143738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5001  sensory box/GGDEF family protein  43.49 
 
 
909 aa  765    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1451  sensory box/ggdef family  94.03 
 
 
914 aa  1721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000257716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5392  sensory box/GGDEF family protein  43.49 
 
 
909 aa  765    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98335e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3761  sensory box/GGDEF family protein  96.8 
 
 
908 aa  1768    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000038986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3847  sensory box/ggdef family  93.81 
 
 
906 aa  1720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1691  sensory box/GGDEF family protein  62.58 
 
 
838 aa  1066    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000833802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.28 
 
 
906 aa  744    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5477  sensory box/GGDEF family protein  44.32 
 
 
909 aa  767    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3794  sensory box/GGDEF family protein  95.69 
 
 
908 aa  1756    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5528  sensory box/GGDEF family protein  44.79 
 
 
909 aa  786    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.024998  hitchhiker  0.000000585102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5422  sensory box/GGDEF family protein  44.87 
 
 
909 aa  791    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.500636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2533  sensory box/GGDEF family protein  61.63 
 
 
912 aa  1130    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3879  sensory box/GGDEF family protein  96.76 
 
 
911 aa  1751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5543  sensory box/GGDEF family protein  43.49 
 
 
909 aa  766    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.129042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  38.05 
 
 
892 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  36.94 
 
 
892 aa  502  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.03 
 
 
892 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  37.82 
 
 
892 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  37.82 
 
 
892 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  37.82 
 
 
892 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  38.27 
 
 
735 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5527  sensory box/GGDEF family protein  43.42 
 
 
604 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  37.22 
 
 
814 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  38.09 
 
 
735 aa  479  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.59 
 
 
723 aa  422  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  34.97 
 
 
925 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05432  hypothetical protein  38.58 
 
 
915 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.48 
 
 
965 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.25 
 
 
916 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0127578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.25 
 
 
916 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.76 
 
 
1070 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.89 
 
 
951 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0630  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.83 
 
 
699 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.17 
 
 
705 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.11 
 
 
947 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.78 
 
 
735 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.737816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.31 
 
 
712 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  42.92 
 
 
1502 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.91 
 
 
1486 aa  386  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.72 
 
 
905 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1237  sensory box protein  35.46 
 
 
712 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2737  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.34 
 
 
951 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0946  sensory box/GGDEF family protein  34.65 
 
 
842 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.25 
 
 
720 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.71 
 
 
585 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.54 
 
 
827 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.1 
 
 
1212 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.06 
 
 
1282 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0958088  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.41 
 
 
1508 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.87 
 
 
730 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.41 
 
 
1508 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.41 
 
 
1508 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2593  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.59 
 
 
608 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0703266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.8 
 
 
821 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000585262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1605  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.17 
 
 
688 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0013251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0703  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.86 
 
 
703 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  36.77 
 
 
1055 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  36.61 
 
 
799 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.54 
 
 
735 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.76 
 
 
659 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.44 
 
 
738 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.18 
 
 
1508 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1905  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.92 
 
 
568 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00246734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.57 
 
 
1209 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001930  sensory box/GGDEF family protein  37.71 
 
 
815 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0672  sensory box protein  35.65 
 
 
1276 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321974  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0703  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.65 
 
 
1276 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26462  normal  0.0640291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0704  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.65 
 
 
1276 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116377  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1829  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.27 
 
 
754 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000110456  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  42.2 
 
 
1515 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4631  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  35.77 
 
 
1278 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.38 
 
 
862 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.22 
 
 
860 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.84 
 
 
925 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3743  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.48 
 
 
722 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.62 
 
 
1147 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.51 
 
 
718 aa  373  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1609  multisensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  35.71 
 
 
944 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2223  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.25 
 
 
725 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.847933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.67 
 
 
631 aa  373  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.38 
 
 
1209 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2044  sensory box/GGDEF family protein  34.3 
 
 
762 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.79 
 
 
705 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  35.93 
 
 
965 aa  369  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.38 
 
 
1228 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>