128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3660 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  43.75 
 
 
228 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  40.36 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  40.36 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  37.22 
 
 
225 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  40.44 
 
 
229 aa  175  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  35.71 
 
 
238 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  37.22 
 
 
227 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  38.25 
 
 
225 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  37.71 
 
 
235 aa  151  8e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  33.78 
 
 
237 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  30.18 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  32.13 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  30.36 
 
 
240 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  29.39 
 
 
240 aa  101  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  25.85 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  25.58 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  26.01 
 
 
210 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  27.11 
 
 
229 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  26.01 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  23.81 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  26.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  22.78 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  22.91 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  26.41 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  21.37 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  22.41 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  23.48 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  22.58 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  24.67 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  25.93 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  22.67 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  27.16 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  21.59 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  20.87 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  24.23 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  22.37 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  20.44 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  25.31 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  20 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  20.27 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  25.12 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  24.89 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  19.07 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  21.93 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  26.25 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  21.9 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  24.67 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  21.5 
 
 
224 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  20.27 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  24.71 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  20.09 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  23.11 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  23.04 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  23.11 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  22.12 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  18.94 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  23.18 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  22.12 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  25 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  21.97 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  21.03 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  21.03 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  23.89 
 
 
224 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.51 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.26 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  23.47 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  18.8 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  22.55 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  21.1 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  20.97 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  20.73 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  18.08 
 
 
288 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  20.61 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  23.79 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  21.03 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  19.56 
 
 
309 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  22.32 
 
 
227 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  19.91 
 
 
224 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  21.98 
 
 
216 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  19.49 
 
 
229 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  22.9 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  21.65 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  21.93 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  18.14 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  20.86 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  18.99 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  20.39 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  23.08 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  18.72 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>