207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3552 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  96.8 
 
 
281 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  94.27 
 
 
281 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  93.91 
 
 
281 aa  543  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  93.55 
 
 
281 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  93.55 
 
 
281 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  88.97 
 
 
281 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  87.54 
 
 
281 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  86.02 
 
 
281 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  94.58 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.79 
 
 
215 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.14 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 
595 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  31.21 
 
 
1442 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  30.46 
 
 
574 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  28.19 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  28.19 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.4 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.76 
 
 
1367 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.76 
 
 
1367 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.57 
 
 
570 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  28.76 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  29.17 
 
 
584 aa  65.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  28.65 
 
 
585 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  29.48 
 
 
719 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
605 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  27.38 
 
 
574 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 
183 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.18 
 
 
181 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  33.09 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  29.28 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  29.28 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  30.32 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  28.41 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.33 
 
 
609 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.5 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  24.86 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.21 
 
 
1421 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  26.11 
 
 
176 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.9 
 
 
1397 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  27.98 
 
 
603 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.74 
 
 
960 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 
207 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 
207 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.66 
 
 
178 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  26.89 
 
 
209 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  29.68 
 
 
207 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.93 
 
 
212 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.01 
 
 
1433 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  27.81 
 
 
613 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  29.87 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  29.87 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  29.87 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  28.33 
 
 
630 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  25.88 
 
 
1449 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  25.7 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.07 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  28.33 
 
 
630 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  28 
 
 
630 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.58 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  27.27 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  25.88 
 
 
1449 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  30.89 
 
 
1388 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.02 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  25.84 
 
 
183 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.18 
 
 
183 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  28.16 
 
 
601 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  30.81 
 
 
1390 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.4 
 
 
610 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  27.59 
 
 
645 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  26.5 
 
 
584 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  27.74 
 
 
185 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  28.07 
 
 
617 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.13 
 
 
186 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.22 
 
 
205 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  28.8 
 
 
1362 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  27.49 
 
 
607 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.95 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  26.49 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.11 
 
 
182 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  27.07 
 
 
183 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  30.86 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  29.22 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  26.63 
 
 
194 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  31.18 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  28.5 
 
 
1635 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  26.47 
 
 
551 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>