206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3344 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  92.51 
 
 
374 aa  726  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  93.05 
 
 
374 aa  726  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  94.12 
 
 
374 aa  738  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  93.58 
 
 
374 aa  732  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  93.58 
 
 
374 aa  728  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  100 
 
 
374 aa  774  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  92.51 
 
 
374 aa  723  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  93.05 
 
 
374 aa  726  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  88.84 
 
 
242 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  48.77 
 
 
368 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  46.87 
 
 
374 aa  355  6e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
380 aa  283  4e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.79 
 
 
369 aa  243  4e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  29.43 
 
 
372 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  25.28 
 
 
359 aa  132  1e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  26.8 
 
 
358 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 
361 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  23.78 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  27.78 
 
 
348 aa  79.3  1e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
370 aa  77.4  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
163 aa  76.3  9e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.70328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 
277 aa  70.1  6e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.1 
 
 
114 aa  64.7  2e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.1 
 
 
114 aa  64.7  2e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 
142 aa  60.8  4e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 
194 aa  60.8  4e-08  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
276 aa  60.1  6e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
262 aa  59.3  9e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
205 aa  59.7  9e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
262 aa  58.9  1e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 
380 aa  59.3  1e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  50 
 
 
146 aa  59.3  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  46.15 
 
 
436 aa  58.5  2e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  43.08 
 
 
143 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  39.34 
 
 
142 aa  58.5  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
183 aa  57.4  4e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  40 
 
 
145 aa  57.4  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 
272 aa  57  5e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
197 aa  57  5e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.38 
 
 
321 aa  57  6e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 
327 aa  56.6  7e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  44.23 
 
 
200 aa  56.6  7e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
142 aa  56.2  8e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
235 aa  56.6  8e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.07 
 
 
210 aa  55.8  1e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
139 aa  55.8  1e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  9.25763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 
262 aa  55.8  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
459 aa  55.8  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  44.23 
 
 
197 aa  55.1  2e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  47.27 
 
 
293 aa  55.1  2e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.39653e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  44.23 
 
 
262 aa  54.7  3e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.23 
 
 
149 aa  54.3  3e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  36.23 
 
 
92 aa  54.3  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 
196 aa  54.7  3e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0134e-07 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  44.26 
 
 
328 aa  54.3  3e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
107 aa  54.3  3e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  36.23 
 
 
149 aa  53.9  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  54.3  4e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
149 aa  53.9  5e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 
197 aa  53.5  6e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  53.5  6e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
192 aa  53.1  7e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
137 aa  53.1  8e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 
135 aa  53.1  8e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  34.78 
 
 
149 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
170 aa  52.4  1e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.32 
 
 
186 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 
266 aa  52.4  1e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
231 aa  52  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
134 aa  52  2e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
104 aa  51.6  2e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.59 
 
 
67 aa  51.6  2e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 
133 aa  51.6  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
137 aa  52  2e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  34.38 
 
 
144 aa  51.2  3e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
149 aa  51.2  3e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 
338 aa  50.8  4e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
273 aa  50.8  4e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
185 aa  50.8  4e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
147 aa  50.8  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
163 aa  50.4  5e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  50.4  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  8.30973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
198 aa  50.1  6e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  7.70501e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
176 aa  50.1  6e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
189 aa  50.1  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
247 aa  50.1  7e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 
189 aa  50.1  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
85 aa  49.7  8e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.39544e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  32.2 
 
 
244 aa  49.7  9e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
268 aa  49.7  9e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.6802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
125 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.24 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.83 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 
196 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>