More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3077 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  95.05 
 
 
647 aa  1276    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  88.87 
 
 
647 aa  1212    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  100 
 
 
647 aa  1330    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  91.19 
 
 
647 aa  1225    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  95.98 
 
 
647 aa  1284    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  90.73 
 
 
647 aa  1224    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  91.19 
 
 
647 aa  1225    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  89.18 
 
 
647 aa  1206    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  91.5 
 
 
647 aa  1227    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  88.56 
 
 
647 aa  1193    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  44.26 
 
 
657 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  44.14 
 
 
662 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  44.12 
 
 
656 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  40.48 
 
 
647 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  40.06 
 
 
651 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  39.88 
 
 
652 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  40.21 
 
 
632 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
661 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  35.69 
 
 
639 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  36.31 
 
 
639 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  31 
 
 
882 aa  287  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  30.03 
 
 
880 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  29.58 
 
 
646 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  29.68 
 
 
646 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  28.7 
 
 
640 aa  266  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  28.73 
 
 
888 aa  265  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  29.47 
 
 
885 aa  264  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  29.17 
 
 
691 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  29.73 
 
 
694 aa  259  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  29.02 
 
 
691 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  27.85 
 
 
700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  28.44 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.75 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  28.77 
 
 
691 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.75 
 
 
691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  27.9 
 
 
691 aa  253  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  28.51 
 
 
693 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  28.51 
 
 
693 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  28.16 
 
 
692 aa  250  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.34 
 
 
692 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  28.15 
 
 
689 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  26.73 
 
 
697 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.46 
 
 
691 aa  248  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  28.14 
 
 
693 aa  247  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  27.82 
 
 
693 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  28.44 
 
 
691 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  27.38 
 
 
704 aa  246  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  27.99 
 
 
689 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  27.75 
 
 
691 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.61 
 
 
691 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.23 
 
 
691 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  28.32 
 
 
704 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  27.31 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.69 
 
 
691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.82 
 
 
642 aa  244  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  27.72 
 
 
704 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  27.27 
 
 
697 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.76 
 
 
691 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  27.83 
 
 
691 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  27.69 
 
 
689 aa  243  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  27.08 
 
 
694 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  26.62 
 
 
697 aa  243  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  27.43 
 
 
691 aa  243  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  28.48 
 
 
682 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  27.35 
 
 
673 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  28.46 
 
 
695 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.57 
 
 
704 aa  241  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.59 
 
 
715 aa  241  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  27.86 
 
 
695 aa  240  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  27.48 
 
 
691 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  27.37 
 
 
692 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  27.34 
 
 
706 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.37 
 
 
690 aa  239  8e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.04 
 
 
695 aa  239  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  28.27 
 
 
703 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  27.79 
 
 
700 aa  239  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  27.23 
 
 
704 aa  239  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  26.8 
 
 
698 aa  239  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  28.36 
 
 
691 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  27.64 
 
 
700 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  27.23 
 
 
704 aa  237  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  27.07 
 
 
691 aa  237  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000344499  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000497299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03142  hypothetical protein  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000419107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  27.04 
 
 
704 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000194361  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.57 
 
 
692 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3757  elongation factor G  27.45 
 
 
704 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000182593  decreased coverage  0.00156911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  28.02 
 
 
701 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  26.89 
 
 
688 aa  236  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  27.91 
 
 
704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  26.89 
 
 
692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0400  elongation factor G  27.19 
 
 
704 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000255179  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  27.76 
 
 
704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  27.91 
 
 
802 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>