More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2597 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2597  ralimis  100 
 
 
345 aa  697    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00028619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  93.62 
 
 
456 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  94.49 
 
 
456 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2329  GntR family transcriptional regulator  93.33 
 
 
456 aa  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00634643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2585  hypothetical protein  93.62 
 
 
443 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  94.2 
 
 
456 aa  667    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2640  hypothetical protein  94.49 
 
 
456 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2556  hypothetical protein  81.45 
 
 
456 aa  587  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.665943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  82.03 
 
 
456 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2399  transcriptional regulator  76.23 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.217005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1446  transcriptional regulator  59.88 
 
 
449 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2228  transcriptional regulator  49.4 
 
 
440 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  43.85 
 
 
421 aa  209  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0099  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
415 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.61 
 
 
517 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
498 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
477 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  26.73 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
520 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
519 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 
402 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.24 
 
 
498 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
393 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
477 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
468 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  25.95 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.65 
 
 
468 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
482 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 
482 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.39 
 
 
493 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  28.53 
 
 
482 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 
482 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  26.16 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 
482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 
394 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
395 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
396 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
397 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  26.59 
 
 
463 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
396 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
480 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
547 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  26.17 
 
 
537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.81 
 
 
488 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
397 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0977  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  25.8 
 
 
394 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
490 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.47 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
488 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  27.89 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  29.46 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0989  putative transcription regulator protein  29.03 
 
 
490 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0613071  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
493 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3842  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
485 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4014  transcriptional regulator  29.08 
 
 
461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920353  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.08 
 
 
500 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0288  transcriptional regulator  24.4 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2384  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 
441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2266  transcriptional regulator  28.63 
 
 
488 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  29.1 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  29.1 
 
 
570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3504  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3115  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.27 
 
 
485 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2869  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.400609  hitchhiker  0.00117486 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 
401 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  24.86 
 
 
399 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 
438 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.53 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
426 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  26.16 
 
 
426 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  29.1 
 
 
493 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.84 
 
 
517 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5687  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
486 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1736  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
486 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2348  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
486 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>