More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2538 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  93.5 
 
 
711 aa  1355    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  63.68 
 
 
710 aa  906    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  68.36 
 
 
712 aa  995    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  100 
 
 
707 aa  1446    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  71.33 
 
 
708 aa  1056    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  67.49 
 
 
717 aa  996    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  63.38 
 
 
706 aa  898    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  95.52 
 
 
583 aa  1142    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  70.76 
 
 
708 aa  1050    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  63.99 
 
 
709 aa  925    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  67.77 
 
 
717 aa  995    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  62.95 
 
 
706 aa  900    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  62.8 
 
 
706 aa  899    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  94.91 
 
 
710 aa  1377    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  70.76 
 
 
708 aa  1049    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  67.77 
 
 
717 aa  995    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  62.57 
 
 
708 aa  894    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  94.21 
 
 
708 aa  1367    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  70.9 
 
 
708 aa  1050    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  67.77 
 
 
717 aa  995    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  62.52 
 
 
706 aa  893    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  94.48 
 
 
710 aa  1373    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  94.77 
 
 
710 aa  1372    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  95.06 
 
 
710 aa  1379    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  66.91 
 
 
717 aa  984    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  67.92 
 
 
717 aa  1000    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  72.6 
 
 
708 aa  1077    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  70.9 
 
 
708 aa  1049    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  70.76 
 
 
708 aa  1050    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  71.67 
 
 
697 aa  1048    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  62.95 
 
 
706 aa  900    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  62.66 
 
 
706 aa  892    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  66.91 
 
 
717 aa  984    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  63.53 
 
 
705 aa  889    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  67.92 
 
 
717 aa  999    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  95.56 
 
 
710 aa  1371    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  51.98 
 
 
709 aa  731    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  72.32 
 
 
708 aa  1065    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  63.53 
 
 
708 aa  912    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  52.55 
 
 
704 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  72.32 
 
 
708 aa  1072    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  43.33 
 
 
691 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  43.33 
 
 
691 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  43.07 
 
 
696 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 
699 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.57 
 
 
692 aa  354  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.14 
 
 
680 aa  318  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  31.51 
 
 
720 aa  310  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  31.99 
 
 
681 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  33.73 
 
 
704 aa  301  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 
688 aa  263  6.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2326  penicillin-binding protein, N-terminal  92.06 
 
 
129 aa  229  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 
709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
701 aa  184  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 
705 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 
700 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.15 
 
 
694 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
636 aa  164  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.81 
 
 
695 aa  163  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.16 
 
 
647 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.19 
 
 
639 aa  160  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 
703 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 
645 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 
671 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.7 
 
 
643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 
648 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  26.4 
 
 
679 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  28.33 
 
 
625 aa  150  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  25.14 
 
 
683 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  27.71 
 
 
634 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.39 
 
 
647 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  27.02 
 
 
646 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  27.29 
 
 
626 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  23.96 
 
 
629 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  27.02 
 
 
646 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  23.36 
 
 
629 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  25.51 
 
 
630 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  24.13 
 
 
629 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  25.74 
 
 
633 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 
609 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  24.06 
 
 
775 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  26.79 
 
 
652 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  24.76 
 
 
803 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.21 
 
 
645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  26.33 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  24.97 
 
 
764 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  26.76 
 
 
646 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  25.29 
 
 
617 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 
802 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 
802 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 
802 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  24.62 
 
 
803 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 
761 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  24.62 
 
 
809 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  25.03 
 
 
802 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  25.83 
 
 
650 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2329  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 
586 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  24.51 
 
 
802 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  25.04 
 
 
633 aa  140  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 
673 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>