218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1910 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  96.55 
 
 		 179 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  95.98 
 
 		 179 aa  336  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  95.98 
 
 		 179 aa  334  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  95.6 
 
 		 179 aa  307  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 242 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  35.09 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  27.93 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  24.72 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  34.96 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.67 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  28.97 
 
 		 305 aa  64.3  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  28.57 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  29.59 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  20.57 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  35.44 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  27.42 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  27.93 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  25.6 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  27 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  27 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  26.28 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  39.19 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  27.93 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  26.02 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 118 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  27.12 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  26.85 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  27.83 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  26.96 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  25.32 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 247 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 249 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>