More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1729 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  100 
 
 
387 aa  759    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  98.97 
 
 
387 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  99.48 
 
 
387 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  99.74 
 
 
387 aa  758    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  97.93 
 
 
387 aa  747    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  99.74 
 
 
387 aa  758    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  98.97 
 
 
387 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  97.67 
 
 
387 aa  747    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  98.97 
 
 
387 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  88.25 
 
 
385 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  99.22 
 
 
387 aa  756    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  75.54 
 
 
375 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  73.92 
 
 
375 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  73.92 
 
 
375 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  73.66 
 
 
375 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  73.66 
 
 
375 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  73.66 
 
 
375 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  55.38 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  39.38 
 
 
389 aa  275  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  40.22 
 
 
375 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  40.34 
 
 
352 aa  260  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 
382 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  38.67 
 
 
386 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  37.05 
 
 
445 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  36.6 
 
 
379 aa  246  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.63 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 
400 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 
396 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 
412 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  37.37 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  33.01 
 
 
423 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 
399 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  33.82 
 
 
424 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.06 
 
 
427 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
395 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  36.2 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.92 
 
 
418 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
412 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
397 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
392 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 
413 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 
415 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
491 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
392 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 
413 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 
402 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
425 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
469 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 
474 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 
398 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
388 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
388 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.3 
 
 
414 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
473 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
404 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 
485 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 
414 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
388 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 
414 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  28.08 
 
 
389 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
748 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
390 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 
455 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 
749 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  28.23 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 
513 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
388 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  28.88 
 
 
584 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 
585 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
585 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  25.68 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
586 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
586 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
756 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
586 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 
767 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
585 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 
586 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.27 
 
 
587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.33 
 
 
587 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 
587 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  31.04 
 
 
460 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.91 
 
 
585 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.3 
 
 
585 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>